의료원 산하기관
대학본부
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- 국제협력처
연구기관
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- 세계학연구소
- 수원발전연구센터
- 과학기술정책·융합연구센터
- 아주중개연구센터
- 아주통일연구소
- 에너지시스템연구센터
- 유비쿼터스컨버전스연구소
- 융복합의료제품 촉진지원센터
- 자동차부품혁신연구센터
- 자율주행모빌리티연구센터
- 장위국방연구소
- 통번역연구소
- 환경연구소
- TOD기반 지속가능 도시·교통연구센터
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- 간호과학연구소
- 노인보건연구센터
- 뇌질환융합연구센터
- 면역네트워크파이오니어연구센터
- 세포치료센터
- 아주중개오믹스센터
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- 외상연구소
- 유전체불안정성 제어연구센터
- 의료정보연구센터
- 의과학연구소
- 의약바이오데이터센터
- 개방형실험실 운영지원센터
- 의학연구협력센터
- 인체유전체자원센터
- 인플라메이징중개의학연구센터
- 임상역학센터
- 지역사회안전증진연구소
- 지역의약품안전센터
- 3차원면역시스템이미징핵심연구지원센터
- 연구중심병원 정책지원센터
- 정신 및 행동장애질환 유효성평가센터
지원기관
- 공과대학 소속
- 다산학부대학 소속
- 교육대학원 소속
- 법학전문대학원 소속
- 법학전문대학원 교수학습지원센터
- 법학전문대학원 교육평가센터
- 법학전문대학원 학생지도센터
- 중소기업법무센터
- 교무혁신처 소속
- 연구정보처 소속
- 학생처 소속
- 총무처 소속
- 국제협력처 소속
- 중앙도서관 소속
- 대학언론사 소속
특별기구
- 평생학습중심대학추진본부
- 성인학위과정운영센터
- 창조인재교육센터
- 평생교육연구개발센터
- 성인학습및HRD컨설팅센터
- 아주브레인추진사업단
의료원
- 의과대학부속병원
- 첨단의학연구원
- 기획조정실
- 대외협력실
- 정보혁신실
산학협력단
- 산학기획팀
- 산학지원팀
- 산학재무팀
- 산학구매팀
- 산학감사팀
- 산학사업팀
- 창의산학교육원
- 신산업기술혁신원